Lagring av PCB krever nøye kontroll av miljøforholdene, da dette er en kjernefaktor som påvirker levetid og pålitelighet. PCB er mest sårbare for fuktighet, høye temperaturer og etsende gasser i luften. Derfor bør det ideelle lagringsmiljøet være tørt, ved romtemperatur og med stabil ventilasjon. Fuktighet anbefales generelt å kontrolleres mellom 40 % og 60 %. Hvis luftfuktigheten i omgivelsene er for høy, vil PCB lett absorbere fuktighet, noe som potensielt kan forårsake "brettsprengning" eller delaminering under påfølgende reflow-lodding. Langvarig-eksponering for luft vil også føre til at loddeputene gradvis oksiderer, noe som påvirker loddeevnen. For plater med høy-presisjon eller de som er lagret over lengre perioder, plasseres de vanligvis i et avfuktende skap eller vakuum-forseglet fuktighetssikker-emballasje, sammen med tørkemidler, for å redusere virkningen av fuktighet.
Emballasje og plassering er også viktig. Ulike stadier av PCB-utvikling krever ulike beskyttelsesnivåer. Umonterte nakne plater er vanligvis forseglet i anti-statiske poser for å forhindre oppbygging av statisk elektrisitet og metalloksidasjon. For PCBAer med monterte komponenter er det nødvendig med ekstra dempingsmateriale for å forhindre kollisjonsskader under transport eller håndtering. Kraftig stabling bør unngås under lagring, spesielt for flerlagsplater eller plater i store-størrelser, siden langvarig påkjenning kan føre til lett vridning eller til og med endringer i indre strukturelle påkjenninger. I lagring anbefales ikke direkte kontakt med bakken eller nærhet til vegger for å minimere påvirkningen av fukttilbakestrømning og temperatursvingninger.
For langtidslagring eller lagerstyring må periodiske inspeksjoner og kontroll av utløpsdato også vurderes. PCB er ikke produkter som kan lagres på ubestemt tid. Selv i gode miljøer vil overflatebehandlingslag (som OSP, immersionsgull og loddeplating) sakte eldes over tid. Derfor settes det vanligvis lagersykluser, for eksempel ny-inspeksjon hver tredje eller sjette måned. Ny-inspeksjon inkluderer kontroll av oksidasjon, endringer i putefarge og integriteten til fuktighetssikker-emballasje. Hvis det oppdages lett oksidasjon, kan loddeevnen gjenopprettes gjennom profesjonell rengjøring eller reprosessering.
